Theo biên bản mới đây của Đội Kiểm tra thuế số 1 Chi cục Thuế Quận 4 thì Công ty TNHH Hoàng Trung kinh doanh sản phẩm dịch vụ phần mềm được hưởng ưu đãi về thuế TNDN với mức thuế suất và thời gian được hưởng theo điểm a, khoản 1, điều 3, quyết định số 128/2000/QĐ-TTg ngày 20/11/2000 của Thủ tướng Chính phủ. Năm 2007, Công ty tự xác định tiếp tục được hưởng ưu đãi đầu tư theo Thông tư 123/2004/TT-BTC ngày 22/12/2004 của Bộ Tài chính, trong đó có hướng dẫn thực hiện ưu đãi về thuế đối với doanh nghiệp phần mềm, theo khoản 1, 2, mục I phần B, với mức thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp ưu đãi là 10% và giảm 50%. Căn cứ theo Thông tư 123 hướng dẫn thực hiện ưu đãi thuế đối với doanh nghiệp phần mềm, đối chiếu với giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh của Công ty Hoàng Trung được cấp lần đầu ngày 10/6/2002, trước thời điểm Thông tư 123 có hiệu lực, giấy phép không ghi cụ thể mức ưu đãi, nên Đoàn Kiểm tra xác định Công ty Hoàng Trung không đủ điều kiện để tiếp tục được hưởng ưu đãi về thuế thu nhập doanh nghiệp theo Thông tư 123 mà chỉ được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp theo điểm 2, khoản 1 điều 3, điều 4 Quyết định số 128/2000/QĐ-TTg ngày 20/11/2000 của Thủ tướng Chính phủ, với thuế suất 25%, miễn thuế 4 năm bắt đầu từ năm 2003 đến hết năm 2006, nghĩa là kể từ năm 2007 không còn ưu đãi về thuế thu nhập doanh nghiệp.
Phản ứng với quyết định trên, ông Phan Xuân Trung, Giám đốc Công ty Hoàng Trung cho rằng phân tích của Chi cục Thuế Quận 4 là không đúng.
Ông Trung viện dẫn Công văn số 1620/TCT-PCCS gửi Hiệp hội Doanh nghiệp Phần mềm Việt Nam ngày 8/5/2006 ghi rõ: “Các doanh nghiệp phần mềm thành lập và hoạt động trong giai đoạn từ năm 2000 – 2005 thì được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp theo hướng dẫn tại điểm 1, 2, 3 mục I, phần B Thông tư số 123/2004/TT-BTC ngày 22/12/2004 của Bộ Tài chính”. Theo đó, Công ty Hoàng Trung thành lập từ năm 2002 nên thuộc diện được hưởng ưu đãi thuế quy định trong Thông tư 123.
Cũng theo phản ánh của ông Trung, hàng năm, Công ty Hoàng Trung đều khai báo quyết toán thuế đến Chi cục Thuế Quận 4 và đều không có phản hồi nào về việc tính thuế ưu đãi từ cơ quan thuế này.
Ông Trung chia sẻ: “Chúng tôi rất bất ngờ khi Chi cục Thuế Quận 4 xác định Công ty Hoàng Trung không được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp”.
“Hầu hết các doanh nghiệp phần mềm tại TP.HCM đang đều gặp phải tình huống tương tự như của Hoàng Trung”, ông Trung cho biết thêm.
Vụ việc này đã được Công ty TNHH Hoàng Trung khiếu nại lên Tổng cục Thuế, Bộ Tài chính.
